A Balaton vízgyűjtő területén több mint 50 halfaj előfordulását írták le. Legalább 30 faj ma is él a tóban, de halászataink során nem szokott 10-15 fajnál több előkerülni. Ennek az az oka, hogy néhány halfaj nem nő meg akkorára, hogy a fogóeszközeinkbe bekerüljön, más fajok meg olyan területen élnek, ahol nem is halászunk. Ezeket a halakat csak speciális eszközökkel lehet megfogni. Ilyen speciális eszköz a kézi elektromos halászgép vagy a különböző szembőségű hálókból épített állított kopoltyú háló, a panelháló.  

A Balaton vízgyűjtő területén előfordult vagy leírt halfajok táblázatait Bíró közölte egy tanulmányában (Bíró P. 1997, Temporal variation in Lake Balaton and its fish populations. Ecology of Freshwater Fish, 6:196-216).
Az első táblázat az őshonos halfajokat foglalja össze, a második azokat a halfajokat, melyeket betelepítettek, vagy a közelmúltban vándoroltak be. Itt természetesen olyan fajok is meg vannak említve, melyek nem a tóban, hanem valamely befolyóban, vagy lápban élnek és jó néhány olyan halfaj is szerepel, melynek egyedeit évek óta nem találta meg senki.

halfaj neve	halfaj tudományos neve	első feljegyzés	származás és gyakoriság	elő- fordulás napjaink- ban
kecsege	Acipenser ruthenus (Linnaeus,1758)	1887	3-C	-
sebes pisztráng	Salmo trutta (Linnaeus,1758)	1906	4-C	-
bodorka	Rutilus rutilus (Linnaeus,1758)	1858	1-A	+
kurta baing	Leucaspius delineatus (Heckel,1843)	1897	3-B	+
fejes domolyó	Leuciscus cephalus (Linnaeus,1758)	1858	1-C	+
jász	Leuciscus idus (Linnaeus,1758)	1895	1-C	+
fürge cselle	Phoxinus phoxinus (Linnaeus,1758)	1858	1-B	+
vörösszárnyú keszeg	Scardinius erythrophthalmus (Linnaeus,1758)	1858	1-A	+
balin	Aspius aspius (Linnaeus,1758)	1858	1-A	+
compó	Tinca tinca (Linnaeus,1758)	1858	1-A	+
fenékjáró küllő	Gobio gobio (Linnaeus,1758)	1858	1-A	+
felpillantó küllő	Gobio uranoscopus (Agassiz,1828)	1895	3-C	+
márna	Barbus barbus (Linnaeus,1758)	1887	1-C	-
állas küsz	Chalcalburnus ch. mento (Agassiz,1828)	1882	1-C	-
szélhajtó küsz	Alburnus alburnus (Linnaeus,1758)	1858	1-A	+
sujtásos küsz	Alburnoides bipunctatus (Bloch,1782)	1861	3-C	-
karika keszeg	Blicca bjoerkna (Linnaeus,1758)	1830	1-A	+
dévér keszeg	Abramis brama (Linnaeus,1758)	1858	1-A	+
bagoly keszeg	Abramis sapa (Palias,1811)	1887	3-C	+
lapos keszeg	Abramis ballerus (Linnaeus,1758)	1858	3-C	+
garda	Pelecus cultratus (Linnaeus,1758)	1830	3-A	+
szivárványos ökle	Rhodeus serlceus amarus (Pallas,1776)	1887	3-A	+
kárász	Carassius carassius (Linnaeus,1758)	1858	3-A	+
ezüst kárász	Carassius auratus gibelio (Linnaeus,1758)	1858	3-B	+
ponty	Cyprinus carpio (Linnaeus,1758)	1858	1-A	+
kövi csík	Barbatulus barbatulus (Linnaeus,1758)	1858	1-B	+
réti csík	Misgurnus fossilis (Linnaeus,1758)	1858	3-B	+
vágó csík	Cobrtis taenia (Linnaeus,1758)	1858	1-B	+
harcsa	Silurus glanis (Linnaeus,1758)	1858	1-A	+
angolna	Anguilla anguilla (Linnaeus,1758)	1890	4-A	+
sügér	Perca fluviatilis (Linnaeus,1758)	1847	1-C	+
lápi póc	Umbra krameri (Walbaum,1792)	1847	2-C	+
csuka	Esox lucius (Linnaeus,1758)	1858	1-A	+
süllő	Stizostedion lucioperca (Linnaeus,1758)	1830	3-A	+
kősüllő	Stizostedion volgensis (Gmelin,1788)	1861	3-A	+
vágó durbincs	Gymnocephalus cernuus (Linnaeus, 1758)	1887	1-A	+
selymes durbincs	Gymnocephalus schraetzer (Linnaeus,1758)	1887	2-C	-(?)
magyar bucó	Zingel zingel (Linnaeus,1766)	1931	2-C	-
német bucó	Zingel streber (Siebold,1863)	1931	2-C	-
tarka géb	Proterorchinus marmoratus (Pallas,1811)	1840	3-C	-(?)
menyhal	Lota lota (Linnaeus,1758)	1887	1-C	-
halványfoltú küllő	Gobio albipinatus (Lukash,1933)			+
jelzések értelmezése: 1= cirkumpoláris faj, 2= endemikus faj a Balatonban, 3=ponto kaszpikus faj, 4= a Dunán keresztül bevándorló faj, A=gyakori, B=közönséges, C=ritka vagy eltünt

halfaj neve	halfaj tudományos neve	betelepítés vagy bevándorlás éve	származás és gyakoriság	elő- fordulás napjaink-ban
kaliforniai lazac	Oncorchynchus tshawytscha (Walbaum,1792)	1884-1981	5-C	-
szivárványos pisztráng	Salmo gairdneri (Richardson,1836)	1975	5-A	+
pataki szajbling	Salvelinus fontinalis (Mitchell,1815)	1975	5-A	-
törpe maréna	Coregonus albula (Linnaeus,1758)	1955, 1958-1959	7-C